De probleemgebiedenvergoeding is een extra subsidie bovenop de vergoeding voor  agrarisch natuurbeheer. Nadat in 2013 bleek dat de provincie hiervoor geen extra middelen van het Rijk zou krijgen, is besloten de extra subsidieregeling te beëindigen. In een brief aan de Staten zegt GS dat dit is gecommuniceerd naar de belangenorganisaties van boeren. De ChristenUnie vraagt waarom de indieners van het subsidieverzoek niet per omgaande op de hoogte zijn gesteld van de beëindiging van de regeling. “Dat had een standaard brief kunnen zijn met extra uitleg waarom de provincie deze regeling niet opnieuw openstelt. Dat had heel wat onrust kunnen voorkomen”, vindt Anja Haga, fractievoorzitter van de ChristenUnie. In maart 2014 is de regeling stopgezet; de eerste aanvragen voor subsidie kwamen binnen in mei van dat jaar.